Protein–RNA interactions for Protein: P25963

NFKBIA, NF-kappa-B inhibitor alpha, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFKBIAP25963 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 PRSS8-206ENST00000568261 1214 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 RSRC1-211ENST00000480820 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 NFAM1-201ENST00000329021 5602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 CFAP100-201ENST00000352312 2086 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 ZBTB7C-201ENST00000535628 4818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AC069287.3-201ENST00000527297 589 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AC133919.2-201ENST00000565965 589 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 ADARB1-202ENST00000360697 6604 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
NFKBIAP25963 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms