Protein–RNA interactions for Protein: P25105

PTAFR, Platelet-activating factor receptor, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTAFRP25105 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 HEXIM2-207ENST00000592695 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 Z83851.2-201ENST00000609564 659 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 LINC00894-202ENST00000425602 1597 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 CACNA1G-202ENST00000354983 8138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 SGCE-206ENST00000445866 1666 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AC104109.2-201ENST00000602919 1418 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 MAPK7-201ENST00000299612 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ATP6V0E2-201ENST00000421974 2605 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ISCA2-201ENST00000298818 851 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 AMACR-208ENST00000512079 858 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 BAX-213ENST00000539787 458 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 COQ9-201ENST00000262507 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 CRELD1-206ENST00000452070 1778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PTAFRP25105 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms