Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 IFT20-214ENST00000585089 1071 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 AGAP4-207ENST00000616763 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 P2RY2-201ENST00000311131 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 RNF146-213ENST00000610153 2070 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 VAT1-202ENST00000420567 1069 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
PTPRGP23470 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 SPATC1L-202ENST00000330205 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 AC091729.1-201ENST00000449721 869 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 NCKAP1-201ENST00000360982 4989 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 AC098850.1-201ENST00000419919 790 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 NEU3-203ENST00000529024 581 ntTSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
PTPRGP23470 AL928654.4-206ENST00000551180 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
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