Protein–RNA interactions for Protein: P23469

PTPRE, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase epsilon, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPREP23469 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 ROPN1L-201ENST00000274134 1066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 SLC25A1P3-201ENST00000395415 828 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 AC012183.1-201ENST00000625197 499 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 EFR3A-201ENST00000254624 5438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.88■□□□□ 0.77
PTPREP23469 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 ELAC2-202ENST00000395962 2924 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 TMEM178A-206ENST00000618232 1286 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 HAUS8-201ENST00000253669 1568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
PTPREP23469 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 IRF9-203ENST00000557894 1391 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
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PTPREP23469 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 PGRMC2-208ENST00000613358 3783 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
PTPREP23469 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
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