Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 FAM86HP-203ENST00000511564 521 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 PFN1-203ENST00000574872 1173 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 TAMM41-212ENST00000630288 607 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 STMN4-202ENST00000350889 2288 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 RN7SL752P-201ENST00000463779 287 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 NFIC-201ENST00000341919 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 GPR152-201ENST00000312457 1429 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PTPRBP23467 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 TPM1-207ENST00000403994 1049 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AC087499.6-201ENST00000411576 835 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTPRBP23467 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
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