Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 SNN-201ENST00000329565 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 METTL21A-202ENST00000406927 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 AC004408.1-201ENST00000579256 573 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 FAM46A-203ENST00000369756 5537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 PCDHA2-203ENST00000526136 5254 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 MYH7B-201ENST00000262873 6293 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 HIPK1-207ENST00000369561 3777 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
ITGA6P23229 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.6 ms