Protein–RNA interactions for Protein: P20648

ATP4A, Potassium-transporting ATPase alpha chain 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,035 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP4AP20648 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 RASL11B-201ENST00000248706 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 SERPINA4-202ENST00000555095 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 ING5-201ENST00000313552 5196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 RILPL2-201ENST00000280571 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 FAM129C-202ENST00000335393 2508 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 F12-201ENST00000253496 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 TMEM143-202ENST00000377431 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 TNPO2-203ENST00000450764 4993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 CDK11A-203ENST00000357760 2446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 CDK11A-204ENST00000358779 2419 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 CDK11A-206ENST00000378638 2429 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 CDK11A-208ENST00000404249 2449 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 RABGGTA-201ENST00000216840 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
ATP4AP20648 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP4AP20648 CNN2P11-201ENST00000429351 262 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP4AP20648 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP4AP20648 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP4AP20648 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
ATP4AP20648 AC105339.1-204ENST00000636249 355 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 135.4 ms