Protein–RNA interactions for Protein: P20396

TRH, Pro-thyrotropin-releasing hormone, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHP20396 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRHP20396 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRHP20396 RAB40B-202ENST00000538809 704 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRHP20396 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRHP20396 RANBP3-220ENST00000591092 1783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRHP20396 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRHP20396 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRHP20396 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRHP20396 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRHP20396 DNASE1L2-204ENST00000567494 1301 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRHP20396 MED9-201ENST00000268711 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
TRHP20396 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 CELA2B-201ENST00000375910 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 AC007969.1-201ENST00000433675 447 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 YIF1B-214ENST00000591784 940 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 LINC00658-206ENST00000600157 901 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 GYG1-214ENST00000627418 1831 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 CCDC34-202ENST00000328697 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
TRHP20396 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRHP20396 ZIM2-206ENST00000599935 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRHP20396 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRHP20396 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRHP20396 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRHP20396 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRHP20396 HADHB-208ENST00000537713 2142 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRHP20396 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRHP20396 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRHP20396 PCOLCE2-208ENST00000485766 1088 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRHP20396 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRHP20396 PTK2-225ENST00000520892 571 ntTSL 4 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRHP20396 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRHP20396 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRHP20396 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRHP20396 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRHP20396 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRHP20396 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRHP20396 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC25.84■■□□□ 1.73
TRHP20396 ZNF528-AS1-202ENST00000596746 929 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRHP20396 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRHP20396 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRHP20396 SLC35A3-208ENST00000638336 2438 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRHP20396 RELA-226ENST00000612991 2266 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRHP20396 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
TRHP20396 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRHP20396 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRHP20396 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRHP20396 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRHP20396 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRHP20396 MRPL55-215ENST00000366742 630 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRHP20396 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRHP20396 AL137856.1-201ENST00000429398 773 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRHP20396 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRHP20396 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRHP20396 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRHP20396 AC107419.1-202ENST00000608735 1081 ntTSL 3 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRHP20396 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRHP20396 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRHP20396 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRHP20396 PFKFB3-204ENST00000379785 2181 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRHP20396 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
TRHP20396 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
TRHP20396 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRHP20396 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRHP20396 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.72
TRHP20396 MAP7D2-203ENST00000443379 2476 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRHP20396 LPAR2-201ENST00000407877 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRHP20396 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRHP20396 SBNO2-201ENST00000361757 4923 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRHP20396 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRHP20396 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRHP20396 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRHP20396 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRHP20396 RPL37A-203ENST00000427280 698 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRHP20396 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
TRHP20396 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
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