Protein–RNA interactions for Protein: P12271

RLBP1, Retinaldehyde-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RLBP1P12271 AC006557.2-201ENST00000592985 1240 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 TUBB4A-209ENST00000598006 565 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 MIR7706-201ENST00000613747 67 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 IRF8-203ENST00000563180 1394 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 GAPDH-201ENST00000229239 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 STK32A-AS1-201ENST00000504297 863 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 CARHSP1-205ENST00000562843 843 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 ABHD13-201ENST00000375898 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 RPRD1A-209ENST00000590898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 AL450267.1-201ENST00000557174 520 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 MOBP-208ENST00000441980 830 ntAPPRIS P4 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 IDH3B-206ENST00000474315 1279 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
RLBP1P12271 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.3 ms