Protein–RNA interactions for Protein: P11686

SFTPC, Pulmonary surfactant-associated protein C, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFTPCP11686 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 DCAF8-218ENST00000610139 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AC007541.1-201ENST00000570282 1469 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 FOXP1-210ENST00000484350 1996 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 B4GALT4-202ENST00000393765 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 SIGLEC6-203ENST00000359982 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 NPFFR2-201ENST00000308744 1922 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AP006294.1-201ENST00000415407 339 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 FAM66C-209ENST00000544214 2623 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 PHC1-212ENST00000543824 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 SYBU-206ENST00000424158 3007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 EBF1-202ENST00000380654 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SFTPCP11686 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
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