Protein–RNA interactions for Protein: P10645

CHGA, Chromogranin-A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 457 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHGAP10645 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHGAP10645 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CHGAP10645 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHGAP10645 SULF2-201ENST00000359930 4915 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHGAP10645 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHGAP10645 SLC44A3-207ENST00000529450 2045 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CHGAP10645 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHGAP10645 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHGAP10645 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHGAP10645 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHGAP10645 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHGAP10645 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHGAP10645 C1QTNF1-201ENST00000311661 2624 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHGAP10645 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHGAP10645 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHGAP10645 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHGAP10645 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHGAP10645 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHGAP10645 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHGAP10645 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
CHGAP10645 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHGAP10645 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHGAP10645 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHGAP10645 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHGAP10645 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHGAP10645 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHGAP10645 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHGAP10645 FDFT1-226ENST00000623368 2368 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHGAP10645 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CHGAP10645 ARHGAP11A-208ENST00000567348 2422 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHGAP10645 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHGAP10645 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHGAP10645 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHGAP10645 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHGAP10645 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHGAP10645 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHGAP10645 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHGAP10645 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CHGAP10645 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHGAP10645 IL11-202ENST00000585513 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHGAP10645 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHGAP10645 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHGAP10645 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHGAP10645 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHGAP10645 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHGAP10645 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHGAP10645 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
CHGAP10645 CXXC5-211ENST00000511048 1892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHGAP10645 LINC00671-201ENST00000301683 1958 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHGAP10645 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHGAP10645 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHGAP10645 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHGAP10645 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHGAP10645 SLC1A6-210ENST00000600144 1735 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHGAP10645 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHGAP10645 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHGAP10645 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHGAP10645 PLK5-201ENST00000334770 2106 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHGAP10645 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
CHGAP10645 AC007405.3-202ENST00000426475 660 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHGAP10645 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHGAP10645 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHGAP10645 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CHGAP10645 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHGAP10645 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHGAP10645 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHGAP10645 TSLP-203ENST00000420978 2621 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHGAP10645 FAM91A1-207ENST00000521166 2706 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHGAP10645 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHGAP10645 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHGAP10645 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHGAP10645 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHGAP10645 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHGAP10645 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHGAP10645 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHGAP10645 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
CHGAP10645 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHGAP10645 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHGAP10645 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHGAP10645 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHGAP10645 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHGAP10645 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHGAP10645 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHGAP10645 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHGAP10645 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CHGAP10645 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHGAP10645 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHGAP10645 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHGAP10645 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHGAP10645 AMIGO1-202ENST00000369864 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHGAP10645 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHGAP10645 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHGAP10645 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHGAP10645 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHGAP10645 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CHGAP10645 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHGAP10645 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHGAP10645 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHGAP10645 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CHGAP10645 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms