Protein–RNA interactions for Protein: P0DJD0

RGPD1, RANBP2-like and GRIP domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,748 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RGPD1P0DJD0 ZNF274-202ENST00000345813 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 AC027575.2-201ENST00000585258 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 AP1S2-201ENST00000329235 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 TMCO1-207ENST00000580248 1735 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 WNT10B-201ENST00000301061 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 GFI1-201ENST00000294702 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
RGPD1P0DJD0 DIABLO-203ENST00000353548 1345 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 SS18L2-201ENST00000011691 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 WASH4P-201ENST00000564273 1246 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 AL033527.4-201ENST00000641026 673 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 B4GALT4-216ENST00000483209 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 ZNF211-203ENST00000299871 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 CAMKV-217ENST00000620470 1485 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 DUSP13-212ENST00000605915 1015 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 ATP5J-205ENST00000400094 589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 ANKRD24-201ENST00000262970 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
RGPD1P0DJD0 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms