Protein–RNA interactions for Protein: P0C7I6

CCDC159, Coiled-coil domain-containing protein 159, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC159P0C7I6 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 AL158047.1-201ENST00000445918 881 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 AC002558.1-201ENST00000488906 803 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 C16orf74-206ENST00000602766 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CCDC159P0C7I6 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 MLLT6-211ENST00000621332 7578 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 PIK3R1-211ENST00000521381 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 RPS2P55-201ENST00000397318 883 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 AC098590.1-201ENST00000468126 897 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 AC107956.1-201ENST00000494359 873 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 CXCL2-202ENST00000508487 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 AC003005.1-201ENST00000601674 582 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 RGS7-203ENST00000366564 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 PIK3R6-203ENST00000614407 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 ANKRD24-206ENST00000600132 4026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 NACAD-202ENST00000490531 4780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 SHQ1-201ENST00000325599 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 DDRGK1-201ENST00000354488 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 MGME1-202ENST00000377709 1936 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 PRDX1-201ENST00000262746 1234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 KLK14-202ENST00000391802 1133 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CCDC159P0C7I6 NFE2L2-201ENST00000397062 2853 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.6 ms