Protein–RNA interactions for Protein: O95931

CBX7, Chromobox protein homolog 7, humanhuman

Predictions only

Length 251 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CBX7O95931 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CBX7O95931 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 PYCR3-201ENST00000220966 2678 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 TMEM59-202ENST00000371337 600 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 NAA60-217ENST00000572942 1089 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 RNH1-204ENST00000397614 1864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
CBX7O95931 CTNNB1-210ENST00000453024 2841 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 ABLIM2-203ENST00000361737 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 MIB2-232ENST00000520777 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
CBX7O95931 C9orf147-204ENST00000463223 863 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms