Protein–RNA interactions for Protein: O95219

SNX4, Sorting nexin-4, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX4O95219 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SNX4O95219 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AC009163.2-201ENST00000460606 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 HES1-201ENST00000232424 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SNX4O95219 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 NAA30-204ENST00000556492 7644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AC010198.1-201ENST00000500076 1552 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
SNX4O95219 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX4O95219 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
SNX4O95219 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms