Protein–RNA interactions for Protein: O60706

ABCC9, ATP-binding cassette sub-family C member 9, humanhuman

Predictions only

Length 1,549 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ABCC9O60706 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 GGT2-202ENST00000405188 1845 ntTSL 5 BASIC33.24■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 MYBPH-202ENST00000621380 1772 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.23■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 HINT2P1-201ENST00000419438 481 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 AC083949.1-202ENST00000458490 552 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 AC090099.4-201ENST00000527671 1027 ntTSL 5 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.22■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 SCYL1-202ENST00000279270 1659 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 AL121983.1-201ENST00000424181 335 ntTSL 2 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.21■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 ACTG1P17-201ENST00000558391 1119 ntBASIC33.2■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.2■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.91
ABCC9O60706 CTCF-202ENST00000401394 2978 ntTSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
ABCC9O60706 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
ABCC9O60706 NEIL2-203ENST00000436750 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
ABCC9O60706 KRT28-201ENST00000306658 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.2■■■□□ 2.9
ABCC9O60706 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ABCC9O60706 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ABCC9O60706 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ABCC9O60706 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
ABCC9O60706 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ABCC9O60706 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ABCC9O60706 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
ABCC9O60706 AL118558.3-201ENST00000607414 1079 ntBASIC33.19■■■□□ 2.9
ABCC9O60706 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC33.19■■■□□ 2.9
ABCC9O60706 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.19■■■□□ 2.9
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms