Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.297e-7■■□□□ 12
PRPF4O43172 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.287e-7■■□□□ 12
PRPF4O43172 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.147e-7■■□□□ 12
PRPF4O43172 TPD52L2-206ENST00000358548 2275 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.067e-7■■□□□ 12
PRPF4O43172 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.177e-7■■□□□ 12
PRPF4O43172 TJP2-210ENST00000606364 591 ntTSL 411.59□□□□□ -0.551e-6■■□□□ 12
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PRPF4O43172 ARMCX3-204ENST00000477980 833 ntTSL 316.55■□□□□ 0.241e-9■■□□□ 12
PRPF4O43172 ARMCX3-205ENST00000479298 637 ntTSL 515.9■□□□□ 0.141e-9■■□□□ 12
PRPF4O43172 ARMCX3-203ENST00000471229 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.041e-9■■□□□ 12
PRPF4O43172 ARMCX3-201ENST00000341189 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.431e-9■■□□□ 12
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PRPF4O43172 ARMCX3-207ENST00000537169 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.061e-9■■□□□ 12
PRPF4O43172 SEPT9-214ENST00000586456 545 ntTSL 219.12■□□□□ 0.654e-11■■□□□ 12
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PRPF4O43172 LUC7L2-204ENST00000456182 2411 ntTSL 1 (best)18.66■□□□□ 0.584e-7■■□□□ 12
PRPF4O43172 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.414e-7■■□□□ 12
PRPF4O43172 LUC7L2-203ENST00000435096 570 ntTSL 317.19■□□□□ 0.344e-7■■□□□ 12
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PRPF4O43172 LUC7L2-208ENST00000541170 1525 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.324e-7■■□□□ 12
PRPF4O43172 C7orf55-LUC7L2-201ENST00000541515 1661 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.39□□□□□ -0.754e-7■■□□□ 12
PRPF4O43172 MT-ND6-201ENST00000361681 525 ntAPPRIS P1 BASIC11.94□□□□□ -0.57e-33■■□□□ 12
PRPF4O43172 RPS6KA2-211ENST00000510118 5992 ntTSL 2 BASIC13.42□□□□□ -0.265e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 RPS6KA2-207ENST00000506565 587 ntTSL 412.16□□□□□ -0.465e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 RPS6KA2-206ENST00000503859 4137 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.595e-6■■□□□ 12
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PRPF4O43172 DNAJC13-201ENST00000260818 7730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.221e-7■■□□□ 12
PRPF4O43172 SKIV2L-207ENST00000471818 706 ntTSL 515.41■□□□□ 0.062e-6■■□□□ 12
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PRPF4O43172 SKIV2L-206ENST00000470453 455 ntTSL 314.38□□□□□ -0.112e-6■■□□□ 12
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PRPF4O43172 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.52e-7■■□□□ 12
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PRPF4O43172 MLLT10-213ENST00000479634 165 ntTSL 1 (best)12.12□□□□□ -0.472e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 MLLT10-214ENST00000480415 297 ntTSL 1 (best)12.12□□□□□ -0.472e-6■■□□□ 12
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PRPF4O43172 ABHD17B-201ENST00000333421 2614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.363e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.472e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.312e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 C21orf2-204ENST00000462742 4532 ntTSL 219■□□□□ 0.632e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.332e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 ARFGEF1-201ENST00000262215 7225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.271e-7■■□□□ 12
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PRPF4O43172 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.863e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC26.5■■□□□ 1.833e-6■■□□□ 12
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PRPF4O43172 AMDHD2-217ENST00000569879 924 ntTSL 318.64■□□□□ 0.573e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.573e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.543e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.543e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.533e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.433e-6■■□□□ 12
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PRPF4O43172 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.343e-6■■□□□ 12
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PRPF4O43172 CD320-206ENST00000599573 861 ntTSL 216.56■□□□□ 0.243e-6■■□□□ 12
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PRPF4O43172 SOX13-206ENST00000525442 538 ntTSL 416.18■□□□□ 0.183e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 AMDHD2-218ENST00000570028 694 ntTSL 216.08■□□□□ 0.163e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 MAZ-209ENST00000565777 1313 ntTSL 216.08■□□□□ 0.163e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 C2-202ENST00000383177 1847 ntTSL 516.01■□□□□ 0.153e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 DDB2-212ENST00000617022 2181 ntTSL 215.99■□□□□ 0.153e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 DDB2-203ENST00000378601 1591 ntTSL 215.93■□□□□ 0.143e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.123e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.074e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 RABGGTA-206ENST00000558649 768 ntTSL 215.06■□□□□ 03e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 WWOX-213ENST00000566662 571 ntTSL 414.95□□□□□ -0.023e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 WWOX-209ENST00000563358 724 ntTSL 314.75□□□□□ -0.053e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 CDC6-204ENST00000580824 696 ntTSL 314.67□□□□□ -0.063e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 PIDD1-205ENST00000527357 4496 ntTSL 214.66□□□□□ -0.064e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 C2-206ENST00000442278 2434 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.083e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC14.45□□□□□ -0.13e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 TMEM192-203ENST00000506087 2225 ntTSL 2 BASIC14.29□□□□□ -0.123e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 CAPN10-215ENST00000493058 907 ntTSL 514.27□□□□□ -0.133e-6■■□□□ 12
PRPF4O43172 C2-209ENST00000452323 1999 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.133e-6■■□□□ 12
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