Protein–RNA interactions for Protein: E9PBE3

Uncharacterized protein, humanhuman

Predictions only

Length 544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E9PBE3 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 GIPR-201ENST00000263281 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 NOTCH2NL-201ENST00000362074 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
E9PBE3 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 EIF5A-204ENST00000416016 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 PCDH1-203ENST00000394536 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 PPP1R21-202ENST00000294952 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 ETV4-205ENST00000545954 1775 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
E9PBE3 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 C17orf62-221ENST00000581196 668 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
E9PBE3 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms