Protein–RNA interactions for Protein: B6SEH9

ERVV-2, Endogenous retrovirus group V member 2 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 535 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVV-2B6SEH9 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 GPER1-207ENST00000619052 571 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 TMEM147-AS1-203ENST00000589137 1627 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 TMEM250-201ENST00000418388 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 NOP14-202ENST00000398071 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 MYZAP-201ENST00000267853 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 PUDP-206ENST00000540122 825 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 ZNF324B-203ENST00000594214 564 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 AC003101.2-201ENST00000612557 442 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 AC009118.2-201ENST00000613275 655 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 MID2-201ENST00000262843 2876 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 AC003002.1-202ENST00000596755 1743 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 TRMT2A-201ENST00000252136 2964 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 WRAP53-203ENST00000431639 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 WRAP53-204ENST00000457584 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ERVV-2B6SEH9 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms