Protein–RNA interactions for Protein: A8MVJ9

Putative histone PARylation factor 1-like, humanhuman

Predictions only

Length 347 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A8MVJ9 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
A8MVJ9 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 SALL3-202ENST00000537592 6555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 ITGB7-202ENST00000422257 2791 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
A8MVJ9 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 GABRB3-202ENST00000311550 5781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 HSPA8-224ENST00000534624 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 KLK6-202ENST00000376851 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
A8MVJ9 WIPF1-201ENST00000272746 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms