Protein–RNA interactions for Protein: A6NGN4

PRAMEF25, PRAME family member 25, humanhuman

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Length 478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRAMEF25A6NGN4 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PRAMEF25A6NGN4 RBFOX1-207ENST00000547338 1513 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 BAIAP2L2-201ENST00000332536 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 PIR-202ENST00000380421 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 WDR13-202ENST00000376729 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
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PRAMEF25A6NGN4 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 RAPGEFL1-212ENST00000620260 3855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 PRAMEF20-201ENST00000316412 1597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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PRAMEF25A6NGN4 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 NUP50-202ENST00000396096 1895 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 MAL-203ENST00000353004 873 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 ENSA-206ENST00000361631 725 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 CENPM-203ENST00000402338 1002 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 RAB42-202ENST00000465518 857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 BX005266.1-201ENST00000473402 457 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 AC020909.1-201ENST00000599632 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRAMEF25A6NGN4 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
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