Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 EML3-202ENST00000394773 3256 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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SNX13Q9Y5W8 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 TTBK1-201ENST00000259750 6932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 PLAUR-201ENST00000221264 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 KHDRBS1-204ENST00000492989 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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SNX13Q9Y5W8 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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SNX13Q9Y5W8 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 CLMAT3-201ENST00000510576 1973 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
SNX13Q9Y5W8 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
SNX13Q9Y5W8 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.33■□□□□ 0.2
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