Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B3

TMED7, Transmembrane emp24 domain-containing protein 7, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMED7Q9Y3B3 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 UFD1-202ENST00000399523 1007 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 ASIC3-203ENST00000357922 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 FAM197Y8-203ENST00000450145 560 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 AC067930.3-201ENST00000524808 701 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 ABO-202ENST00000538324 1147 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 SMIM20-205ENST00000614775 1190 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 NECAB2-203ENST00000565691 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 TTLL10-201ENST00000379288 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 LINC00336-201ENST00000477984 2107 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 AC005920.1-201ENST00000501718 2054 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 LINC01569-202ENST00000573042 2093 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 AP002414.1-201ENST00000391405 1147 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 LINC01972-201ENST00000422271 553 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 AC134772.1-202ENST00000435578 549 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
TMED7Q9Y3B3 ARTN-206ENST00000472435 402 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms