Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQ13

SHOC2, Leucine-rich repeat protein SHOC-2, humanhuman

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Length 582 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHOC2Q9UQ13 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 AC003688.1-201ENST00000577138 489 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 AC092171.3-201ENST00000610122 2651 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 RNASEK-203ENST00000549393 783 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 AD001527.2-201ENST00000622994 785 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 SPRED2-206ENST00000443619 1800 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 HPCAL1-206ENST00000613496 1547 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
SHOC2Q9UQ13 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 ABCD1P5-201ENST00000445663 754 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 AC073592.5-201ENST00000624854 528 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 AC132938.5-201ENST00000624980 1813 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
SHOC2Q9UQ13 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
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