Protein–RNA interactions for Protein: Q9UPU3

SORCS3, VPS10 domain-containing receptor SorCS3, humanhuman

Predictions only

Length 1,222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS3Q9UPU3 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 CRYGN-201ENST00000337323 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 GK-202ENST00000378941 458 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 PARD6G-203ENST00000470488 596 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 AC055854.1-201ENST00000523627 570 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 TERF1P3-201ENST00000505638 1227 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 SLC7A9-202ENST00000587772 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 PLCG1-201ENST00000244007 5285 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 KLF3-201ENST00000261438 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 LINC02242-201ENST00000507298 641 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 AC123777.1-201ENST00000534827 1247 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SORCS3Q9UPU3 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms