Protein–RNA interactions for Protein: Q9ULV1

FZD4, Frizzled-4, humanhuman

Predictions only

Length 537 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FZD4Q9ULV1 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 REEP1-208ENST00000538924 1702 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 RPL28-209ENST00000560055 670 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 AC024592.3-202ENST00000586349 506 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 GULP1-209ENST00000410051 1595 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 WNT5B-202ENST00000397196 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 NDFIP1-201ENST00000253814 3851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 SELENOF-201ENST00000331835 1781 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 SPAST-202ENST00000345662 5116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 RTN4-204ENST00000357732 2390 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 SIL1-201ENST00000265195 1895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 TPSAB1-202ENST00000461509 1357 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
FZD4Q9ULV1 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms