Protein–RNA interactions for Protein: Q9UJ41

RABGEF1, Rab5 GDP/GTP exchange factor, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGEF1Q9UJ41 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 GALNT18-201ENST00000227756 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 TCF3-212ENST00000588136 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 MAGEA4-206ENST00000393921 1727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 CLDN6-202ENST00000396925 1739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 TCEAL3-201ENST00000243286 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 AC019205.2-201ENST00000442007 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 ATPAF2-213ENST00000585101 566 ntTSL 4 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 PCDHA7-202ENST00000525929 5221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 SERPINB6-207ENST00000612421 1570 ntTSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.56■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 ANGPTL4-202ENST00000393962 1705 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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RABGEF1Q9UJ41 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 MRPL21-208ENST00000567045 932 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 AC109462.3-201ENST00000573934 613 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
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RABGEF1Q9UJ41 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
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RABGEF1Q9UJ41 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 KDM5C-204ENST00000375401 6031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
RABGEF1Q9UJ41 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
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