Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHJ3

SFMBT1, Scm-like with four MBT domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 866 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFMBT1Q9UHJ3 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 PARD3-201ENST00000340077 3518 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 HOXA2-201ENST00000222718 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 LINC01657-201ENST00000457217 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 HOXC6-201ENST00000243108 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.83■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
SFMBT1Q9UHJ3 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 TPD52L1-211ENST00000532429 1022 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 CCNYL1-201ENST00000295414 3767 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 ANKRD23-202ENST00000331001 2455 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 ADGRB2-202ENST00000373658 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC17.83■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 WWOX-204ENST00000408984 1227 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 AC087163.2-201ENST00000457299 853 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 AL133375.1-201ENST00000500590 980 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 AC002985.2-201ENST00000601106 957 ntTSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 SCNN1D-206ENST00000400928 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 MADCAM1-204ENST00000587541 1723 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 SLC25A6P2-201ENST00000497974 877 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 CSRNP1-201ENST00000273153 3148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 FFAR2-201ENST00000246549 2051 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 TMEM45B-201ENST00000281441 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
SFMBT1Q9UHJ3 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms