Protein–RNA interactions for Protein: Q9UHC1

MLH3, DNA mismatch repair protein Mlh3, humanhuman

Predictions only

Length 1,453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MLH3Q9UHC1 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 FUZ-207ENST00000526575 482 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 CTSB-220ENST00000531089 1436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 LAMP1-201ENST00000332556 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 PLCXD1-202ENST00000381663 1863 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 AL450998.2-201ENST00000418525 639 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 CD82-201ENST00000227155 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 POC1B-GALNT4-201ENST00000547474 2207 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 RABEPK-201ENST00000259460 1313 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 NXT2-202ENST00000372103 1085 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 SSBP3-216ENST00000610401 3168 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 PIGT-257ENST00000640210 1715 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
MLH3Q9UHC1 MAEA-201ENST00000264750 2058 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 WAS-201ENST00000376701 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 AC010327.1-201ENST00000587871 975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 MECP2-205ENST00000453960 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 POMP-201ENST00000380842 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 PRKAG1-206ENST00000548065 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
MLH3Q9UHC1 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms