Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGU5

HMGXB4, HMG domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMGXB4Q9UGU5 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 ADAMTSL1-202ENST00000327883 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 SAMD11-202ENST00000342066 2551 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 SAMD11-217ENST00000622503 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 RWDD4-202ENST00000327570 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 PCDHA12-202ENST00000613593 2588 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 TLE3-205ENST00000539550 2464 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 ZNF385A-203ENST00000394313 2430 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
HMGXB4Q9UGU5 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 KRT18P3-201ENST00000451602 1288 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 MCUR1-201ENST00000379170 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
HMGXB4Q9UGU5 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms