Protein–RNA interactions for Protein: Q9UGM1

CHRNA9, Neuronal acetylcholine receptor subunit alpha-9, humanhuman

Predictions only

Length 479 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHRNA9Q9UGM1 ASPH-211ENST00000518068 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 DKFZP434K028-202ENST00000536405 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 MARCH1-203ENST00000503008 5877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 USP3-AS1-201ENST00000558831 1784 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 PEX10-201ENST00000288774 2871 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 TRIM27-201ENST00000377194 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 PRAP1-202ENST00000463201 587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 TNFSF13-208ENST00000483039 959 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 CACNA1G-206ENST00000416767 4899 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 AP2S1-202ENST00000352203 793 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 AL591212.1-201ENST00000433646 615 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 MTUS2-205ENST00000542829 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 SOCS7-201ENST00000612932 7857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 CHST8-201ENST00000262622 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
CHRNA9Q9UGM1 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 NOP16-205ENST00000509257 1000 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
CHRNA9Q9UGM1 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms