Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBU2

DKK2, Dickkopf-related protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK2Q9UBU2 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 RAD23A-201ENST00000316856 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC12.82□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 KLK5-201ENST00000336334 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AL603756.1-201ENST00000606511 2163 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 DYNLL1-203ENST00000392509 814 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 ITM2C-204ENST00000409704 1106 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 CSNK1A1L-201ENST00000379800 2406 ntAPPRIS P1 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.81□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 APBB1-207ENST00000529519 1442 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 GPR158-AS1-201ENST00000449643 2433 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 PEX14-201ENST00000356607 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 LINGO1-AS2-201ENST00000557799 663 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 ACP6-201ENST00000392988 1555 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC12.8□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
DKK2Q9UBU2 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.79□□□□□ -0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms