Protein–RNA interactions for Protein: Q9UBP4

DKK3, Dickkopf-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 350 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DKK3Q9UBP4 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 AQP6-205ENST00000618286 829 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 PACS2-205ENST00000547217 2809 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 PHF20L1-209ENST00000395386 6237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 GOSR2-202ENST00000393456 788 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 AP005233.2-201ENST00000561588 372 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 URAHP-203ENST00000517889 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 TRIM33-202ENST00000369543 3457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 DOC2B-203ENST00000613549 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 NR4A2-203ENST00000409108 1735 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 Z97056.1-201ENST00000433230 556 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 DDIT4-AS1-201ENST00000491934 847 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
DKK3Q9UBP4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.2 ms