Protein–RNA interactions for Protein: Q9P003

CNIH4, Protein cornichon homolog 4, humanhuman

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Length 139 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNIH4Q9P003 KLC2-203ENST00000394066 2591 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 VEGFA-205ENST00000372067 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 INIP-202ENST00000374236 874 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 AP006621.3-203ENST00000525941 610 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 AP000688.1-201ENST00000535199 1221 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 HYAL3-202ENST00000359051 1635 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 FN1-208ENST00000426059 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 ARHGAP33-201ENST00000007510 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 HNRNPDP1-201ENST00000439535 754 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 TMEM106C-203ENST00000449758 1414 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 TRIM17-204ENST00000366698 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 JMJD6-205ENST00000585429 1330 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 ANHX-201ENST00000419717 1765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
CNIH4Q9P003 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
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