Protein–RNA interactions for Protein: Q9NZR2

LRP1B, Low-density lipoprotein receptor-related protein 1B, humanhuman

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Length 4,599 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRP1BQ9NZR2 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 RPL28-206ENST00000558752 671 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 FAM174A-201ENST00000312637 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 SGK2-207ENST00000426287 1182 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 AC020915.1-202ENST00000427361 922 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 IGHV3OR16-16-201ENST00000563644 343 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 GNA11-201ENST00000078429 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 AC138356.1-201ENST00000330539 2086 ntTSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 FAM57B-201ENST00000279389 1481 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 ARHGAP4-204ENST00000393721 2721 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 APP-203ENST00000354192 3167 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 LCE1A-201ENST00000335123 422 ntAPPRIS P1 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 LINC01759-203ENST00000635271 888 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 APOA5-203ENST00000542499 1929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 SPSB2-204ENST00000523102 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 SPSB2-205ENST00000524270 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 SKOR2-202ENST00000425639 3899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
LRP1BQ9NZR2 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.68□□□□□ -0.7
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