Protein–RNA interactions for Protein: Q9NYR9

NKIRAS2, NF-kappa-B inhibitor-interacting Ras-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NKIRAS2Q9NYR9 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 PCBP4-203ENST00000428823 1835 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 KIF3A-202ENST00000378746 6325 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 TOM1-204ENST00000411850 2390 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 RPL36-202ENST00000394580 556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF549-203ENST00000594943 556 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 UNC5D-203ENST00000416672 3532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 ACP5-201ENST00000218758 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 XPO1-201ENST00000401558 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 SMARCC2-202ENST00000347471 3839 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
NKIRAS2Q9NYR9 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms