Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT62

ATG3, Ubiquitin-like-conjugating enzyme ATG3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG3Q9NT62 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 GOLPH3-201ENST00000265070 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 OTOL1-201ENST00000327928 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 ATP6AP2-225ENST00000637482 1648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 LARGE2-201ENST00000325468 2522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 CCDC92-201ENST00000238156 2787 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 ARRB2-203ENST00000381488 1236 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 RAB17-204ENST00000409822 1077 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 LEPROTL1-204ENST00000518192 847 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 SNHG28-203ENST00000621242 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 ANKRD6-204ENST00000447838 2968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 ARHGAP9-202ENST00000393797 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 PPFIA1-201ENST00000253925 5234 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 AL662799.1-202ENST00000614205 422 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 PSRC1-201ENST00000369903 1710 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 AL359815.1-201ENST00000457706 821 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
ATG3Q9NT62 POC1A-203ENST00000474012 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms