Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS6

SNX15, Sorting nexin-15, humanhuman

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX15Q9NRS6 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 PAPD5-202ENST00000436909 4635 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 C3orf58-201ENST00000315691 4346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 MADCAM1-203ENST00000382683 603 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 TRIM73-203ENST00000437796 1169 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 TSSC2-201ENST00000450217 709 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 HCCS-202ENST00000380762 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 DRAXINP1-201ENST00000437611 948 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 AP001453.1-201ENST00000534988 923 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 CIB2-208ENST00000560618 804 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 JPH2-202ENST00000372980 4787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 FAM184A-214ENST00000621231 4048 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
SNX15Q9NRS6 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms