Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRJ7

PCDHB16, Protocadherin beta-16, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDHB16Q9NRJ7 EYA4-205ENST00000430974 2364 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 NTMT1-211ENST00000617943 1346 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 PODXL-202ENST00000378555 2105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AL139423.1-201ENST00000606802 7923 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 DAGLA-201ENST00000257215 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SPDYE15P-201ENST00000424157 909 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 GOLGA7-202ENST00000405786 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 LRRTM1-202ENST00000409148 2126 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 PLEKHG6-203ENST00000396988 2963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AC116353.5-201ENST00000638148 1699 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 LGMN-201ENST00000334869 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 CLDN15-202ENST00000401528 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 RAP2C-201ENST00000342983 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 KRT18P57-201ENST00000443599 1254 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 DEUP1-206ENST00000530273 410 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 FAM181A-203ENST00000556222 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 TMED1-207ENST00000591695 809 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 GPAT2-204ENST00000453542 2466 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 S1PR2-201ENST00000590320 3582 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PCDHB16Q9NRJ7 ZMIZ2-202ENST00000309315 5144 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.8 ms