Protein–RNA interactions for Protein: Q9NQP4

PFDN4, Prefoldin subunit 4, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PFDN4Q9NQP4 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 GALNT11-205ENST00000430044 2727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 GUCA2A-201ENST00000357001 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 IL18BP-214ENST00000620017 1566 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 HPDL-201ENST00000334815 1629 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 GFI1B-208ENST00000636263 1604 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 SRSF1-201ENST00000258962 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 TCEAL4-201ENST00000372629 1511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 BEX1-201ENST00000372728 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 AC103564.2-201ENST00000432853 1299 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 COLCA2-205ENST00000614153 1264 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 UBC-206ENST00000538617 1303 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 AIDA-201ENST00000340020 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 PNO1-201ENST00000263657 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 DHX36-202ENST00000329463 2985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 EPB41L3-202ENST00000342933 4270 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 C2CD4C-201ENST00000332235 3129 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 GRB7-201ENST00000309156 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
PFDN4Q9NQP4 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
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