Protein–RNA interactions for Protein: Q9HD43

PTPRH, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase H, humanhuman

Predictions only

Length 1,115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRHQ9HD43 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 EVPLL-201ENST00000399134 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 AL390334.1-205ENST00000555797 411 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 AC005256.1-202ENST00000592934 415 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 UNC119-204ENST00000470125 2050 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 FOXRED2-203ENST00000397223 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 HERPUD2-202ENST00000396081 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 GNB2-205ENST00000419828 1285 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 PLCG1-202ENST00000373271 7395 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 FBXL7-202ENST00000504595 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 LSP1-203ENST00000405957 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 AP001062.3-201ENST00000422357 704 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
PTPRHQ9HD43 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms