Protein–RNA interactions for Protein: Q9HC77

CENPJ, Centromere protein J, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,338 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPJQ9HC77 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 SLC9A6-201ENST00000370695 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 AC092809.2-202ENST00000436706 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 GAK-222ENST00000618573 1248 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 LINC02012-201ENST00000608206 1725 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 NECAB1-201ENST00000417640 5289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 TLE3-226ENST00000627388 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 MAPK8IP3-202ENST00000356010 4456 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 NFKB2-201ENST00000189444 3011 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 WWC3-201ENST00000380861 6647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
CENPJQ9HC77 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 CDH23-212ENST00000616684 4814 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 MAP3K6-207ENST00000493901 4309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 TNFRSF13B-206ENST00000583789 859 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 UGGT2-202ENST00000376714 1233 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 AC005759.1-201ENST00000594805 855 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 AC093512.1-201ENST00000617969 520 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 UGGT2-212ENST00000621375 1004 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 UGGT2-213ENST00000638479 1010 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 BSG-203ENST00000353555 1616 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 EDC3-202ENST00000426797 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
CENPJQ9HC77 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.5 ms