Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZQ3

COMMD5, COMM domain-containing protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COMMD5Q9GZQ3 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.86□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.86□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 CHRM2-201ENST00000320658 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 ZNF397-204ENST00000585800 2046 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 HSD17B10-201ENST00000168216 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 BPHL-208ENST00000434640 1186 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 AC016582.2-201ENST00000591908 446 ntTSL 3 BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 TNFRSF14-AS1-205ENST00000449660 1629 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 ANTXRL-206ENST00000622632 1964 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.85□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 ADAM22-202ENST00000398201 2784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 AC018695.7-201ENST00000624587 2492 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 FBXO18-201ENST00000362091 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 SCNN1A-205ENST00000396966 2336 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 AC099329.3-201ENST00000431549 602 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 AC124947.2-201ENST00000547118 1133 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 BCL2L12-210ENST00000611631 1259 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 HMOX2-217ENST00000619528 1829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 NDRG2-204ENST00000360463 2047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 ADAMTS13-201ENST00000355699 4442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
COMMD5Q9GZQ3 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms