Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 TNFSF13-205ENST00000396545 1593 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 YBEY-201ENST00000329319 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 CBL-204ENST00000634840 4813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 ASB10-202ENST00000377867 1738 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 VPS13B-201ENST00000355155 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 CROCCP2-202ENST00000412962 2773 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 MEGF9-201ENST00000373930 6298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 AL109955.1-201ENST00000417346 1540 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 DNAJC4-203ENST00000355040 759 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 TVP23C-204ENST00000438826 1852 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 SLX1A-SULT1A3-202ENST00000565342 2195 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 VPS26A-202ENST00000373382 3229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 NDUFA3-201ENST00000303553 379 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CEP44Q9C0F1 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms