Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYQ0

KRTAP9-8, Keratin-associated protein 9-8, humanhuman

Predictions only

Length 159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KRTAP9-8Q9BYQ0 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.93□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRIM58-201ENST00000366481 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 NFS1-202ENST00000374085 2645 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 CD164L2-203ENST00000374030 993 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 MTND2P3-201ENST00000452458 470 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 CXCL11-202ENST00000503860 767 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM108-AS1-201ENST00000504993 705 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLNS1A-210ENST00000528364 953 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP002008.1-201ENST00000530283 1155 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC140912.1-201ENST00000577171 1054 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC079336.1-201ENST00000583156 420 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC016493.1-201ENST00000586106 688 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM205-208ENST00000587948 688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM205-211ENST00000589555 788 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 LINC00896-202ENST00000609602 2128 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC126175.1-201ENST00000617041 758 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 SLC29A1-202ENST00000371713 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 OTUD5-204ENST00000428668 1493 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC011447.7-201ENST00000624228 1590 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 CPXCR1-201ENST00000276127 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC7.92□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 TSPAN7-202ENST00000378482 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 CLDN7-203ENST00000538261 1923 ntTSL 5 BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
KRTAP9-8Q9BYQ0 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.91□□□□□ -1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms