Protein–RNA interactions for Protein: Q9BY67

CADM1, Cell adhesion molecule 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 442 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1Q9BY67 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 EPS8L2-223ENST00000533256 3266 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 MPG-201ENST00000219431 1193 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 PRR31-201ENST00000371629 978 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 MDK-204ENST00000395569 686 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 CTNNBIP1-204ENST00000400904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 AF131216.3-201ENST00000525867 1099 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 AC009061.1-201ENST00000567261 475 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 HYAL3-205ENST00000450982 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 MTFP1-202ENST00000355143 891 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 TSPAN4-209ENST00000409543 1031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 BX088651.1-201ENST00000540551 451 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 TGIF1-222ENST00000577543 729 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 AC073648.6-201ENST00000641589 218 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 PLCD3-212ENST00000619929 6107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 CLEC10A-204ENST00000571664 1442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 KCNMA1-219ENST00000480683 2963 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 ANO1-201ENST00000316296 2118 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 ZNF134-203ENST00000600344 483 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CADM1Q9BY67 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms