Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXF6

RAB11FIP5, Rab11 family-interacting protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC38A6-202ENST00000354886 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 SNAP23-201ENST00000249647 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ZAR1L-201ENST00000345108 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 CD99-204ENST00000381187 892 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 LBH-204ENST00000406087 559 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 INPP5A-203ENST00000368594 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 PPP3CA-203ENST00000394854 4685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 KLHDC8B-201ENST00000332780 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 LINC01979-201ENST00000576738 5271 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 SHOX-204ENST00000554971 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 THAP7-202ENST00000399133 1144 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AL049612.1-201ENST00000427017 694 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 LDLRAD2-203ENST00000543870 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AC091167.2-201ENST00000579581 588 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 PIN1-206ENST00000587625 878 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 KLK3-201ENST00000326003 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 GATA2-202ENST00000430265 2525 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 ERLEC1-201ENST00000185150 2433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 CPEB2-AS1-201ENST00000500394 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 PRDM5-212ENST00000515109 2259 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 LILRA6-201ENST00000245621 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 DPM3-203ENST00000368400 409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 TNNT3-203ENST00000381557 1019 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AP1S3-203ENST00000396654 830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 NTMT1-205ENST00000459968 1123 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 RNA5SP416-201ENST00000516838 111 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
RAB11FIP5Q9BXF6 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms