Protein–RNA interactions for Protein: Q9BU64

CENPO, Centromere protein O, humanhuman

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPOQ9BU64 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 WNT10B-203ENST00000407467 1802 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 NDRG4-202ENST00000356752 1375 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 NDUFA1-201ENST00000371437 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 C16orf90-202ENST00000437192 907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 AC008649.1-201ENST00000589557 516 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 CD209-209ENST00000601256 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 MAPK7-203ENST00000395602 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 TEAD4-201ENST00000358409 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 LYAR-201ENST00000343470 1569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 SLC29A1-203ENST00000371724 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 TRIP10-210ENST00000600428 2249 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 SRI-203ENST00000419179 1307 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 MPV17L-202ENST00000396385 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 AL590666.2-201ENST00000448869 758 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 ZNF346-203ENST00000503425 1191 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 AC090877.2-202ENST00000560363 574 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 MAGEA6-201ENST00000329342 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 FAM98A-201ENST00000238823 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 KCNQ2-204ENST00000359125 3253 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 TRNT1-205ENST00000402675 1935 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 LTBP4-205ENST00000396819 4764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 SNAPC1-201ENST00000216294 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CENPOQ9BU64 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.2 ms