Protein–RNA interactions for Protein: Q9BPW4

APOL4, Apolipoprotein L4, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL4Q9BPW4 PDE9A-213ENST00000398236 1776 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 LARP6-201ENST00000299213 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 SLCO4A1-AS1-202ENST00000433126 1420 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 ZFYVE21-202ENST00000311141 1383 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 FGFBP1-201ENST00000382333 1359 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 METTL27-201ENST00000297873 941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 UPK3B-203ENST00000394849 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 ZNF524-203ENST00000591046 1260 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 SPINK2-206ENST00000618802 608 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 PCCB-207ENST00000466072 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 TGIF1-219ENST00000551541 990 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 CROCCP2-205ENST00000639481 1296 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 EGFEM1P-202ENST00000431685 1563 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 ONECUT1-201ENST00000305901 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 HLA-A-202ENST00000376806 1854 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 IGFBP7-AS1-201ENST00000499667 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 PWP1-202ENST00000541166 1722 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 AC134349.1-201ENST00000543969 385 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
APOL4Q9BPW4 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.5 ms