Protein–RNA interactions for Protein: Q99856

ARID3A, AT-rich interactive domain-containing protein 3A, humanhuman

Predictions only

Length 593 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARID3AQ99856 DGUOK-AS1-203ENST00000453103 601 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 PNLDC1-207ENST00000610273 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 RBM26-203ENST00000438737 4132 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 GAB3-203ENST00000424127 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 EIPR1-201ENST00000382125 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 PRRX1-202ENST00000367760 2217 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 PCDH19-202ENST00000373034 9756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 HOPX-201ENST00000317745 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 AP003396.3-201ENST00000530918 778 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
ARID3AQ99856 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 CFL1-203ENST00000525451 1878 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 AL109797.1-201ENST00000452501 835 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 PTGES-201ENST00000340607 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 CENPT-215ENST00000564817 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 ITSN1-210ENST00000399353 3913 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
ARID3AQ99856 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33 ms